2000年4月10-12日，中国植物油行业协会理事会暨植物油行业与WTO研讨会在北京举行。参加会议的有外经贸部、农业部、国家粮食局、中国世贸组织研究会等单位的领导和专家、学者；有协会领导、常务理事、理事、会员单位代表等，共计270人参加了会议。
研讨会针对我国加入WTO提出了7个研究课题，邀请了农业部农村经济研究中心高级研究员刘志仁、外经贸部国际贸易研究院研究员李永江、农业部种植业司粮油处处长曾令清、美国大豆协会住京首席代表雷天龙等8位层次较高的专家做了前瞻性的专题报告。
会议期间，协会召开了理事会，听取了秘书处关于对协会昆明会议之后工作情况的汇报，研究了协会今后的工作，提出了加强和改善协会内部管理的要求和强化服务意识、发扬敬业精神和加强团队合作。会议还决定了对会员队伍进行整顿，采取吐故纳新的措施。
研讨会结束时，中国植物油公司副总经理、协会副会长李国欣代表协会领导作了总结发言。
2000年5月17-18日，由中国植物油公司副总经理、协会副会长矫庆丰为团长，由协会、中国植物油公司及四川、上海、山西、浙江、福建、湖北、山东、宁波、安徽省（市）油脂公司共同组成的中国代表团一行14人，出席了在伦敦召开的71届国际榨油商协会世界大会。并赴瑞士与嘉吉公司座谈和交流了信息。
2000年6月12日，协会根据广大会员加工企业的要求和国家有关职能部门2000年93号文件免征豆粕等8种饼粕增值税问题，向国务院上报了“关于免增豆粕增值税将对植物油行业产生影响的报告”，阐述了豆粕免征增值税将影响国家农业种植结构的调整，减少国家税金的收入，冲击油脂加工企业的正常经营，并提出了鼓励多进料少进油的产业政策建议，得到了国务院的认可和采纳。
2000年6月14-16日，中国植物油行业协会在江西省九江市召开了“全国油菜籽生产及资源配置研讨会”。国家粮食局调控司的代表和协会领导及油菜籽主产（销）区的代表共50多人参加了会议。
研讨会交流了油菜籽生产、收购和加工等情况，分析了农业种植结构调整中油菜籽生产的发展趋势，探讨了油菜籽的资源配置问题，研究了植物油行业面临的问题和对策。
2000年11月21日，中国植物油行业协会在四川省乐山市召开了协会第二届第五次常务理事会、理事会。中国植物油公司总经理、协会会长高秀山主持会上批准了增选了北京艾森绿宝油脂有限公司、南海油脂工业（赤湾）有限公司、湖北中昌植物油有限公司、大连华农企业集团为协会理事。批准吸收了汕头保税区中星油脂有限公司、山东坤华集团油脂有限公司等15个新会员。同时批准清退了6个因合并、转产、撤消、倒闭等原因，不履行协会义务的会员单位。
2000年11月22-24日，中国植物油行业协会在四川省乐山市召开了’2000会员代表大会。参加大会的有29个省、自治区、直辖市的会员单位和其他企业的代表。国家经贸委、农业部、国家粮食局及协会有关领导也参加了会议，参会人数达280多人。
中国植物油公司总经理、协会会长高秀山和协会常务副会长林永清、协会副会长董朝永分别主持了大会。
会上，会长高秀山首先向大会致了词。林永清常务副会长向大会作了《开创中国植物油行业协会工作新局面》工作报告。国家经贸委企业改革司毛元斌副处长，作了《关于当前国有企业改革的总体状况和几个热点问题的报告》；农业部种植业司曾令清处长，向大代表介绍了当年国内油料生产情况，分析了下一年油料生产发展的趋势；国家粮食局调控司卢景波副司长，向代表们做了《关于粮食宏观调控和今年粮油购销情况的报告》。秋油主产省的山东、河南、河北、吉林、新疆等省（自治区）的油脂公司还在大会上介绍了本辖区内秋油产、购、销情况，分析预测了油脂（油料）市场供求走势。
会议还总结了协会工作、研究了下一步工作计划，座谈了国有企业改革、脱困的经验和问题。在会议结束时，林永清常务副会长做了总结发言。